Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms