Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL4P36578 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL4P36578 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL4P36578 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL4P36578 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL4P36578 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL4P36578 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL4P36578 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL4P36578 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL4P36578 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL4P36578 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL4P36578 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL4P36578 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL4P36578 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL4P36578 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL4P36578 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL4P36578 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL4P36578 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL4P36578 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL4P36578 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL4P36578 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL4P36578 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL4P36578 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL4P36578 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL4P36578 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL4P36578 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL4P36578 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL4P36578 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms