Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA7P36544 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA7P36544 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms