Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 SH3YL1-224ENST00000488044 672 ntTSL 417.47■□□□□ 0.396e-13■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 NR1H2-212ENST00000600355 507 ntTSL 316.77■□□□□ 0.282e-8■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 SH3YL1-220ENST00000475027 599 ntTSL 513.96□□□□□ -0.176e-13■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 SH3YL1-210ENST00000454318 581 ntTSL 313.39□□□□□ -0.276e-13■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 SH3YL1-204ENST00000403658 1279 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.386e-13■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 SH3YL1-225ENST00000488979 541 ntTSL 511.47□□□□□ -0.576e-13■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 SH3YL1-202ENST00000402632 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.626e-13■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 SH3YL1-215ENST00000468321 2739 ntTSL 1 (best)9.74□□□□□ -0.856e-13■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 SH3YL1-218ENST00000472861 441 ntTSL 39.54□□□□□ -0.886e-13■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 SH3YL1-214ENST00000465733 551 ntTSL 49.54□□□□□ -0.886e-13■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 DNA2-202ENST00000399179 3207 ntTSL 29.14□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.086e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.386e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 SH3YL1-212ENST00000462719 569 ntTSL 46.17□□□□□ -1.426e-13■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 SH3YL1-207ENST00000415368 494 ntTSL 36□□□□□ -1.456e-13■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.651e-12■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.771e-12■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.523e-8■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.23e-8■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.73e-8■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 PHF23-204ENST00000570899 649 ntTSL 317.63■□□□□ 0.413e-8■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 SOGA1-202ENST00000279034 3703 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.322e-8■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.981e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.581e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 KAT8-205ENST00000539683 1051 ntTSL 219.15■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.842e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.842e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.842e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.442e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 MPC1-205ENST00000487218 918 ntTSL 58.86□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 MPC1-204ENST00000475708 651 ntTSL 52.96□□□□□ -1.942e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 MSH6-203ENST00000420813 491 ntTSL 419.58■□□□□ 0.722e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.172e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.14e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 KIAA1217-205ENST00000376456 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.53□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 KIAA1217-210ENST00000438429 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.25□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 KIAA1217-208ENST00000396446 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 KIAA1217-207ENST00000396445 5706 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.684e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.814e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.864e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 KIAA1217-201ENST00000307544 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.884e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.348e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.358e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.528e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.578e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.017e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 ADGRD1-203ENST00000376682 4135 ntTSL 213.78□□□□□ -0.27e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 ADGRD1-205ENST00000535015 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.597e-7■■■■■ 28.4
GTF2F1P35269 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.449e-7■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.799e-7■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.359e-7■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.829e-7■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 OLA1-203ENST00000392560 711 ntTSL 59.72□□□□□ -0.859e-7■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 OLA1-207ENST00000429575 485 ntTSL 39.48□□□□□ -0.899e-7■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.891e-7■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 GRAMD1A-212ENST00000600231 2534 ntTSL 224.53■■□□□ 1.521e-7■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 ZSCAN5A-216ENST00000592679 923 ntTSL 224.08■■□□□ 1.456e-8■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 ZSCAN5A-215ENST00000592509 589 ntTSL 216.26■□□□□ 0.196e-8■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.016e-8■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 ZSCAN5A-205ENST00000587340 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.266e-8■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 ZSCAN5A-212ENST00000591078 686 ntTSL 312.38□□□□□ -0.436e-8■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 ZSCAN5A-209ENST00000588955 576 ntTSL 412□□□□□ -0.496e-8■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 ZSCAN5A-217ENST00000593106 849 ntTSL 511.65□□□□□ -0.546e-8■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 ZSCAN5A-210ENST00000589279 686 ntTSL 211.39□□□□□ -0.596e-8■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 ZSCAN5A-202ENST00000585670 314 ntTSL 39.66□□□□□ -0.866e-8■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 ZSCAN5A-207ENST00000587614 589 ntTSL 49.4□□□□□ -0.96e-8■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 ZSCAN5A-208ENST00000588442 576 ntTSL 47.92□□□□□ -1.146e-8■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 UBE2J2-216ENST00000488418 750 ntTSL 220.61■□□□□ 0.897e-7■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.755e-7■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 SSBP4-215ENST00000625926 162 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.487e-7■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 AGFG2-203ENST00000430857 915 ntTSL 529.05■■■□□ 2.242e-10■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 AGFG2-205ENST00000477022 1327 ntTSL 1 (best)22.25■■□□□ 1.152e-10■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.092e-10■■■■■ 28.3
GTF2F1P35269 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.475e-9■■■■■ 28.2
GTF2F1P35269 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.895e-9■■■■■ 28.2
GTF2F1P35269 SETD5-202ENST00000399686 3362 ntTSL 58.96□□□□□ -0.975e-9■■■■■ 28.2
GTF2F1P35269 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.025e-9■■■■■ 28.2
GTF2F1P35269 MBOAT7-207ENST00000449249 707 ntTSL 522.75■■□□□ 1.239e-7■■■■■ 28.2
GTF2F1P35269 MBOAT7-213ENST00000495279 1585 ntTSL 220.68■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 28.2
GTF2F1P35269 BSG-209ENST00000574970 570 ntTSL 424.61■■□□□ 1.531e-7■■■■■ 28.2
GTF2F1P35269 BSG-208ENST00000573784 559 ntTSL 421.34■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 28.2
GTF2F1P35269 BSG-211ENST00000576984 544 ntTSL 419.76■□□□□ 0.751e-7■■■■■ 28.2
GTF2F1P35269 SHANK2-220ENST00000608988 1879 ntTSL 526.96■■□□□ 1.915e-7■■■■■ 28.2
GTF2F1P35269 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 28.2
GTF2F1P35269 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.072e-8■■■■■ 28.2
GTF2F1P35269 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 28.2
GTF2F1P35269 NSD2-202ENST00000353275 7980 ntTSL 1 (best)12.59□□□□□ -0.392e-8■■■■■ 28.2
GTF2F1P35269 NSD2-201ENST00000312087 8050 ntTSL 1 (best)11.73□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 28.2
GTF2F1P35269 B3GNTL1-205ENST00000571394 774 ntTSL 317.52■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 28.2
GTF2F1P35269 B3GNTL1-208ENST00000572977 2446 ntTSL 216.14■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 28.2
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 214.5 ms