Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSG3P32926 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSG3P32926 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG3P32926 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG3P32926 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG3P32926 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG3P32926 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG3P32926 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG3P32926 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG3P32926 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG3P32926 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG3P32926 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG3P32926 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG3P32926 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG3P32926 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG3P32926 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSG3P32926 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG3P32926 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG3P32926 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG3P32926 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG3P32926 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG3P32926 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG3P32926 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG3P32926 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG3P32926 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG3P32926 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG3P32926 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG3P32926 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG3P32926 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG3P32926 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG3P32926 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG3P32926 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG3P32926 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSG3P32926 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSG3P32926 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSG3P32926 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSG3P32926 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG3P32926 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms