Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP1P32455 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP1P32455 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP1P32455 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP1P32455 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP1P32455 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP1P32455 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP1P32455 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP1P32455 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP1P32455 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP1P32455 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP1P32455 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP1P32455 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP1P32455 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP1P32455 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP1P32455 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP1P32455 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP1P32455 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP1P32455 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP1P32455 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP1P32455 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP1P32455 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP1P32455 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP1P32455 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms