Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRS3P32247 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRS3P32247 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRS3P32247 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRS3P32247 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRS3P32247 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRS3P32247 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRS3P32247 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRS3P32247 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRS3P32247 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRS3P32247 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRS3P32247 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRS3P32247 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRS3P32247 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRS3P32247 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRS3P32247 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRS3P32247 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRS3P32247 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRS3P32247 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRS3P32247 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRS3P32247 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRS3P32247 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BRS3P32247 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRS3P32247 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRS3P32247 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRS3P32247 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
BRS3P32247 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRS3P32247 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRS3P32247 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRS3P32247 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRS3P32247 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms