Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF1P30408 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms