Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HTR2AP28223 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms