Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IL3RAP26951 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms