Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNE1P24864 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms