Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms