Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CD247P20963 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CD247P20963 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CD247P20963 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD247P20963 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CD247P20963 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD247P20963 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CD247P20963 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD247P20963 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CD247P20963 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CD247P20963 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD247P20963 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD247P20963 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD247P20963 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD247P20963 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD247P20963 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD247P20963 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD247P20963 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD247P20963 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD247P20963 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD247P20963 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD247P20963 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD247P20963 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD247P20963 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD247P20963 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD247P20963 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD247P20963 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD247P20963 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD247P20963 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD247P20963 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD247P20963 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD247P20963 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD247P20963 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD247P20963 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD247P20963 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD247P20963 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD247P20963 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD247P20963 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD247P20963 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD247P20963 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD247P20963 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD247P20963 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD247P20963 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms