Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB4AP20338 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms