Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RCC1P18754 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RCC1P18754 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RCC1P18754 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RCC1P18754 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RCC1P18754 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RCC1P18754 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RCC1P18754 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RCC1P18754 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RCC1P18754 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RCC1P18754 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RCC1P18754 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RCC1P18754 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RCC1P18754 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RCC1P18754 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RCC1P18754 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RCC1P18754 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RCC1P18754 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RCC1P18754 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RCC1P18754 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCC1P18754 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCC1P18754 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCC1P18754 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCC1P18754 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCC1P18754 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCC1P18754 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCC1P18754 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCC1P18754 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCC1P18754 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCC1P18754 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms