Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN1P18031 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN1P18031 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms