Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNT1P13805 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms