Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms