Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODC1P11926 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ODC1P11926 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODC1P11926 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODC1P11926 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODC1P11926 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODC1P11926 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODC1P11926 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODC1P11926 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODC1P11926 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODC1P11926 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODC1P11926 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ODC1P11926 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODC1P11926 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODC1P11926 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ODC1P11926 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODC1P11926 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODC1P11926 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODC1P11926 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODC1P11926 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODC1P11926 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODC1P11926 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODC1P11926 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODC1P11926 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODC1P11926 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODC1P11926 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODC1P11926 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODC1P11926 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODC1P11926 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODC1P11926 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODC1P11926 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODC1P11926 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODC1P11926 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODC1P11926 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ODC1P11926 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODC1P11926 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODC1P11926 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODC1P11926 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODC1P11926 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODC1P11926 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODC1P11926 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODC1P11926 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODC1P11926 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODC1P11926 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODC1P11926 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODC1P11926 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODC1P11926 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODC1P11926 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODC1P11926 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODC1P11926 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ODC1P11926 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ODC1P11926 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODC1P11926 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODC1P11926 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODC1P11926 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODC1P11926 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODC1P11926 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODC1P11926 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODC1P11926 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODC1P11926 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODC1P11926 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODC1P11926 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODC1P11926 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODC1P11926 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODC1P11926 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODC1P11926 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODC1P11926 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODC1P11926 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODC1P11926 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms