Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLUP10909 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLUP10909 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLUP10909 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLUP10909 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLUP10909 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLUP10909 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUP10909 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUP10909 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLUP10909 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLUP10909 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLUP10909 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLUP10909 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLUP10909 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms