Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHGAP10645 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHGAP10645 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHGAP10645 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHGAP10645 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHGAP10645 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHGAP10645 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHGAP10645 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHGAP10645 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHGAP10645 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHGAP10645 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CHGAP10645 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHGAP10645 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHGAP10645 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHGAP10645 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHGAP10645 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHGAP10645 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHGAP10645 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHGAP10645 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHGAP10645 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHGAP10645 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHGAP10645 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHGAP10645 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHGAP10645 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHGAP10645 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHGAP10645 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHGAP10645 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHGAP10645 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHGAP10645 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHGAP10645 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHGAP10645 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHGAP10645 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHGAP10645 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHGAP10645 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHGAP10645 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHGAP10645 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHGAP10645 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHGAP10645 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHGAP10645 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHGAP10645 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CHGAP10645 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHGAP10645 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHGAP10645 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHGAP10645 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHGAP10645 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHGAP10645 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHGAP10645 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHGAP10645 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHGAP10645 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHGAP10645 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHGAP10645 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHGAP10645 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHGAP10645 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHGAP10645 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHGAP10645 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHGAP10645 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHGAP10645 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHGAP10645 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHGAP10645 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CHGAP10645 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHGAP10645 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHGAP10645 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHGAP10645 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHGAP10645 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHGAP10645 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHGAP10645 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHGAP10645 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CHGAP10645 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CHGAP10645 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHGAP10645 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHGAP10645 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHGAP10645 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHGAP10645 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHGAP10645 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHGAP10645 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHGAP10645 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHGAP10645 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHGAP10645 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CHGAP10645 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHGAP10645 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHGAP10645 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHGAP10645 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHGAP10645 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHGAP10645 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHGAP10645 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHGAP10645 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHGAP10645 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHGAP10645 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHGAP10645 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHGAP10645 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHGAP10645 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHGAP10645 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHGAP10645 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHGAP10645 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHGAP10645 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CHGAP10645 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHGAP10645 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHGAP10645 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHGAP10645 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHGAP10645 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms