Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGHG1P01857 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms