Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOL3O95236 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOL3O95236 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
APOL3O95236 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOL3O95236 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOL3O95236 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOL3O95236 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOL3O95236 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOL3O95236 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOL3O95236 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOL3O95236 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOL3O95236 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOL3O95236 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOL3O95236 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOL3O95236 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOL3O95236 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOL3O95236 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms