Protein–RNA interactions for Protein: O94822

LTN1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, humanhuman

Predictions only

Length 1,766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTN1O94822 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTN1O94822 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTN1O94822 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTN1O94822 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTN1O94822 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTN1O94822 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTN1O94822 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTN1O94822 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTN1O94822 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LTN1O94822 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTN1O94822 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTN1O94822 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTN1O94822 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTN1O94822 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTN1O94822 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LTN1O94822 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTN1O94822 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTN1O94822 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LTN1O94822 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTN1O94822 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LTN1O94822 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTN1O94822 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTN1O94822 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTN1O94822 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTN1O94822 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LTN1O94822 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTN1O94822 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTN1O94822 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTN1O94822 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTN1O94822 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTN1O94822 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTN1O94822 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTN1O94822 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTN1O94822 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTN1O94822 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTN1O94822 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LTN1O94822 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTN1O94822 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTN1O94822 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTN1O94822 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LTN1O94822 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTN1O94822 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTN1O94822 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTN1O94822 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTN1O94822 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTN1O94822 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTN1O94822 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTN1O94822 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTN1O94822 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTN1O94822 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTN1O94822 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTN1O94822 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTN1O94822 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTN1O94822 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTN1O94822 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTN1O94822 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTN1O94822 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTN1O94822 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTN1O94822 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTN1O94822 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTN1O94822 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTN1O94822 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LTN1O94822 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LTN1O94822 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LTN1O94822 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTN1O94822 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTN1O94822 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTN1O94822 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTN1O94822 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTN1O94822 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTN1O94822 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTN1O94822 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTN1O94822 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTN1O94822 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTN1O94822 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTN1O94822 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTN1O94822 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTN1O94822 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LTN1O94822 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LTN1O94822 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LTN1O94822 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LTN1O94822 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LTN1O94822 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LTN1O94822 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
LTN1O94822 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LTN1O94822 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LTN1O94822 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LTN1O94822 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LTN1O94822 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTN1O94822 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTN1O94822 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTN1O94822 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTN1O94822 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTN1O94822 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTN1O94822 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTN1O94822 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTN1O94822 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTN1O94822 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTN1O94822 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTN1O94822 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms