Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX3O75364 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX3O75364 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX3O75364 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX3O75364 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms