Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
N4BP1O75113 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms