Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNQ3O43525 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms