Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO3O43524 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXO3O43524 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms