Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTRA2O43464 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTRA2O43464 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms