Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTIFO43310 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTIFO43310 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTIFO43310 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTIFO43310 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTIFO43310 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTIFO43310 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTIFO43310 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTIFO43310 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTIFO43310 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTIFO43310 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTIFO43310 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTIFO43310 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTIFO43310 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTIFO43310 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTIFO43310 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTIFO43310 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTIFO43310 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTIFO43310 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTIFO43310 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTIFO43310 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTIFO43310 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTIFO43310 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTIFO43310 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTIFO43310 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTIFO43310 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTIFO43310 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTIFO43310 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTIFO43310 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTIFO43310 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTIFO43310 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTIFO43310 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTIFO43310 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTIFO43310 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTIFO43310 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTIFO43310 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTIFO43310 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTIFO43310 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTIFO43310 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTIFO43310 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTIFO43310 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTIFO43310 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTIFO43310 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTIFO43310 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTIFO43310 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTIFO43310 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTIFO43310 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTIFO43310 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTIFO43310 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTIFO43310 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTIFO43310 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTIFO43310 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTIFO43310 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTIFO43310 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTIFO43310 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTIFO43310 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTIFO43310 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTIFO43310 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTIFO43310 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTIFO43310 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTIFO43310 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTIFO43310 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTIFO43310 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTIFO43310 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTIFO43310 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTIFO43310 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTIFO43310 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTIFO43310 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTIFO43310 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTIFO43310 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CTIFO43310 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTIFO43310 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTIFO43310 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTIFO43310 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTIFO43310 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTIFO43310 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTIFO43310 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTIFO43310 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTIFO43310 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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