Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRODHO43272 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRODHO43272 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRODHO43272 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRODHO43272 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRODHO43272 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRODHO43272 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRODHO43272 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRODHO43272 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRODHO43272 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRODHO43272 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRODHO43272 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRODHO43272 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRODHO43272 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRODHO43272 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRODHO43272 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRODHO43272 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRODHO43272 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRODHO43272 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRODHO43272 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRODHO43272 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRODHO43272 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRODHO43272 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRODHO43272 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRODHO43272 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRODHO43272 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRODHO43272 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRODHO43272 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRODHO43272 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRODHO43272 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRODHO43272 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRODHO43272 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRODHO43272 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRODHO43272 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRODHO43272 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRODHO43272 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRODHO43272 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRODHO43272 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRODHO43272 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRODHO43272 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRODHO43272 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRODHO43272 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRODHO43272 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRODHO43272 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRODHO43272 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRODHO43272 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRODHO43272 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRODHO43272 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRODHO43272 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRODHO43272 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRODHO43272 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRODHO43272 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRODHO43272 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRODHO43272 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRODHO43272 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRODHO43272 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRODHO43272 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRODHO43272 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRODHO43272 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRODHO43272 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRODHO43272 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRODHO43272 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRODHO43272 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRODHO43272 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRODHO43272 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms