Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD3O43242 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD3O43242 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms