Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DYNC1LI2O43237 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms