Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN3O15551 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN3O15551 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms