Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARPC5O15511 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARPC5O15511 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms