Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPL2O15504 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms