Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A2O14975 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A2O14975 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms