Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX7O00628 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms