Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 SPG21-213ENST00000561078 1520 ntTSL 515.86■□□□□ 0.132e-11■■■■■ 33.9
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DDX3XO00571 SSRP1-204ENST00000529002 648 ntTSL 518.45■□□□□ 0.549e-13■■■■■ 33.9
DDX3XO00571 SSRP1-202ENST00000293880 6296 ntTSL 216.31■□□□□ 0.29e-13■■■■■ 33.9
DDX3XO00571 SSRP1-201ENST00000278412 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.399e-13■■■■■ 33.9
DDX3XO00571 ARL8B-203ENST00000429403 709 ntTSL 519.35■□□□□ 0.697e-21■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 ARL8B-204ENST00000444332 732 ntTSL 218.61■□□□□ 0.577e-21■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 ARL8B-205ENST00000455168 1641 ntTSL 218.33■□□□□ 0.527e-21■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.417e-21■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.347e-21■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.17e-21■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.897e-12■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.887e-12■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 KXD1-213ENST00000600372 656 ntTSL 319.15■□□□□ 0.667e-12■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 KXD1-215ENST00000600796 396 ntTSL 318.21■□□□□ 0.517e-12■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.57e-12■■■■■ 33.8
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DDX3XO00571 MAD2L1-202ENST00000333047 1277 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.261e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 MAD2L1-204ENST00000511295 528 ntTSL 214.98□□□□□ -0.011e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.151e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.821e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.661e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.631e-11■■■■■ 33.8
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DDX3XO00571 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.641e-11■■■■■ 33.8
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DDX3XO00571 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.221e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.381e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 ZNF395-203ENST00000517459 224 ntTSL 220.35■□□□□ 0.853e-8■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.489e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.489e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 AC037459.1-201ENST00000450780 977 ntTSL 523.79■■□□□ 1.49e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.369e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.949e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.939e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.899e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.899e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.679e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 PDLIM2-214ENST00000452226 845 ntTSL 218.82■□□□□ 0.69e-11■■■■■ 33.8
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DDX3XO00571 AC037459.1-203ENST00000447849 794 ntTSL 517.85■□□□□ 0.459e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 PDLIM2-208ENST00000416159 880 ntTSL 517.79■□□□□ 0.449e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 PDLIM2-220ENST00000622226 6559 nt15.36■□□□□ 0.059e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.049e-11■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 PDLIM2-213ENST00000448520 894 ntTSL 314.26□□□□□ -0.139e-11■■■■■ 33.8
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DDX3XO00571 BCL2L1-207ENST00000439267 781 ntTSL 212.16□□□□□ -0.468e-12■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 BCL2L1-204ENST00000420488 820 ntTSL 210.69□□□□□ -0.78e-12■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.564e-10■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.44e-10■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.07■□□□□ 05e-88■■■■■ 33.8
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DDX3XO00571 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.696e-13■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.386e-13■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.236e-13■■■■■ 33.8
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DDX3XO00571 OCIAD1-203ENST00000396448 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.496e-13■■■■■ 33.8
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DDX3XO00571 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.556e-13■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 OCIAD1-201ENST00000264312 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.596e-13■■■■■ 33.8
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DDX3XO00571 OCIAD1-221ENST00000510824 582 ntTSL 39.36□□□□□ -0.916e-13■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 OCIAD1-209ENST00000505922 555 ntTSL 57.47□□□□□ -1.216e-13■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.366e-13■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 OCIAD1-207ENST00000503016 720 ntTSL 34.6□□□□□ -1.676e-13■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 OCIAD1-218ENST00000509246 495 ntTSL 24.57□□□□□ -1.686e-13■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 OCIAD1-208ENST00000504654 552 ntTSL 34.46□□□□□ -1.76e-13■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 OCIAD1-222ENST00000511102 688 ntTSL 23.71□□□□□ -1.826e-13■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.864e-7■■■■■ 33.8
DDX3XO00571 YIF1A-206ENST00000474986 860 ntTSL 1 (best)23.8■■□□□ 1.46e-8■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 YIF1A-213ENST00000534374 540 ntTSL 223.68■■□□□ 1.386e-8■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 YIF1A-202ENST00000376899 1042 ntTSL 223.6■■□□□ 1.376e-8■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.266e-8■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.266e-8■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.996e-8■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 YIF1A-207ENST00000484814 541 ntTSL 321.25■□□□□ 0.996e-8■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 FBXO7-209ENST00000492535 6884 ntTSL 58.45□□□□□ -1.068e-17■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 AP2S1-209ENST00000601498 898 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.481e-10■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.46■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 DICER1-207ENST00000529206 1286 ntTSL 522.37■■□□□ 1.171e-7■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.871e-7■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.593e-11■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 FOXA1-204ENST00000554607 789 ntTSL 323.97■■□□□ 1.437e-28■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.631e-22■■■■■ 33.7
DDX3XO00571 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.171e-22■■■■■ 33.7
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