Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BL2E5RIL1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms