Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN25C9JDP6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms