Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD3A6NKT7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGPD3A6NKT7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGPD3A6NKT7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms