Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23AA6NH52 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23AA6NH52 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms