Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMNCA6NCL1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMNCA6NCL1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMNCA6NCL1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMNCA6NCL1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMNCA6NCL1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GMNCA6NCL1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GMNCA6NCL1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GMNCA6NCL1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms