Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL33A6NCF5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL33A6NCF5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms