Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.28■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XIRP2A4UGR9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XIRP2A4UGR9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms