Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 AL353898.3-201ENST00000624679 1755 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 TARS2P1-201ENST00000506124 2041 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 FBXO9-203ENST00000370939 1580 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 LINC00934-202ENST00000630357 2291 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AC036108.4-201ENST00000611654 2516 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 SOX5-203ENST00000396007 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 PLCE1-AS1-201ENST00000425267 1370 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 RAB13-205ENST00000614713 1353 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 CAP1-201ENST00000340450 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 PVALB-201ENST00000216200 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 KRTAP11-1-201ENST00000332378 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 FAM209B-201ENST00000371325 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 HEATR5A-201ENST00000382464 507 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 SNORA14B-201ENST00000384452 135 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AL136380.2-201ENST00000411837 492 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AP001116.1-201ENST00000421604 762 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 Z83838.1-201ENST00000431036 925 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AL441963.1-201ENST00000435137 792 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 LINC00445-202ENST00000456848 643 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AC093270.1-201ENST00000482584 486 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 GAPDHP22-201ENST00000491037 413 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 CSF2RA-217ENST00000494969 489 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 CFL1P5-201ENST00000508046 502 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 EGFLAM-AS1-201ENST00000508986 331 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 OR10J2P-201ENST00000514684 961 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AC090835.1-201ENST00000515189 1024 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AC091901.1-201ENST00000517722 736 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AP000879.2-201ENST00000530525 497 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 OR4C9P-201ENST00000532368 925 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 STXBP6-204ENST00000546511 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 CD63-206ENST00000548160 648 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AC010536.2-201ENST00000563036 338 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 WWOX-AS1-201ENST00000567099 443 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 ZNF793-AS1-205ENST00000589025 560 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 ACP5-208ENST00000590420 301 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 ZNF283-205ENST00000590950 466 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 ZNF415-223ENST00000601215 561 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AC018926.2-201ENST00000611214 498 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AC087742.2-201ENST00000616113 740 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 SNHG5-218ENST00000623901 711 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 LINC01727-204ENST00000624385 940 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 GTF2H2-201ENST00000274400 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 USP37-204ENST00000418019 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 GLI1-201ENST00000228682 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 ANXA2-202ENST00000396024 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 USP28-205ENST00000537706 1900 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 DEPDC1B-202ENST00000453022 1569 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 BMS1P1-201ENST00000374336 1332 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 PPP3CA-205ENST00000507176 1958 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 APBB2-224ENST00000513140 4166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 RAD9B-207ENST00000409778 1373 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 CCL28-201ENST00000361115 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 KRBOX1-201ENST00000383748 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 ZNF816-ZNF321P-201ENST00000391777 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 GLS-205ENST00000409626 997 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AC074117.1-203ENST00000412749 399 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 SDHDP2-201ENST00000436937 465 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AC018738.1-201ENST00000441378 210 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AC107983.1-201ENST00000442562 210 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 RN7SL856P-201ENST00000461754 298 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 RPL12P8-201ENST00000482081 580 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 MYL5-205ENST00000505477 584 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AC025244.1-201ENST00000505930 469 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AC093297.2-202ENST00000514597 659 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 MIR2052HG-204ENST00000523442 550 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AC109466.1-203ENST00000524297 1083 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTGFRP43088 AC104031.1-201ENST00000527726 372 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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