Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HSPB11Q9Y547 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB11Q9Y547 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB11Q9Y547 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB11Q9Y547 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB11Q9Y547 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB11Q9Y547 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB11Q9Y547 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB11Q9Y547 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB11Q9Y547 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB11Q9Y547 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB11Q9Y547 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB11Q9Y547 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB11Q9Y547 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms