Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC6Q9Y210 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms