Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PHF8Q9UPP1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF8Q9UPP1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms